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1、存在形式不同。磷酸基團(tuán)一般是指磷酸�；�，即磷酸脫去一個(gè)羥基的結(jié)構(gòu)，也可以是脫去兩個(gè)羥基的磷酸基團(tuán)，比如ATP、核苷酸等；而磷酸就是指無機(jī)物磷酸，一般是以分子形式存在。
2、化學(xué)性質(zhì)不同。磷酸基團(tuán)具有很強(qiáng)的配合能力，能與許多金屬離子生成可溶性的配合物。如Fe3+與PO43-可以生成無色的可溶性的配合物[Fe(PO4)2]3-和[Fe(HPO4)2]-；而磷酸屬于二元中強(qiáng)酸，可以與各種堿性物質(zhì)和金屬發(fā)生反應(yīng)，也可以用于制備其它酸。
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